Początkowo występujący pod nazwą "stoner rock" lub "stoned rock", ten gatunek powstał w wyniku przeniesienia stylu Kyuss na grunt metalowy. Nie oznaczał jednak, że twórczość Spiritual Beggars czy Orange Goblin była "kamienna". Słowo "stoned" oznaczało po prostu "zjarany" lub "narąbany", Termin pochodził z 1993 i miał go po raz pierwszy użyć współtwórca grupy Sleep - Matt Pike. W 1997 termin funkcjonował już w prasie europejskiej - w "Rock Hard" Frequences From Planet Ten Orange Goblin została nazwana w ten sposób.
Dla większości podgatunków muzycznych, bardzo ciężko wskazać konkretną drogę ich powstania. Niemniej jednak stoner ma swoich przodków i charakterystyczne utwory, które wpłynęły na kształt gatunku. Blue Cheer w drugiej połowie lat 60-tych jako jedni z pierwszych wprowadzili do muzyki przerażającą wręcz ścianę ogłuszających gitar i przesterowanego basu. Stoner w zasadzie serwuje spowolnienie i spotęgowanie bluesowego riffu - trwałego dziedzictwa Mississippi. Niegdyś Led Zeppelin i Black Sabbath jako pierwsi przekuli go w monolit, jednakże za ojców chrzestnego gatunku uważa się Sir Lord Baltimore, Leaf Hound, a nawet Primevil ze swoim numerem Touchstone. Korzeni stonera można się także doszukać na Master Of Reality Sabbathów, Machine Head Deep Purple, dokonaniach Hawkwind i Blue Öyster Cult. Zespoły stonerowe zmodernizowały długie skręcające umysł riffy tych zespołów dzięki filtrowaniu psychodelicznego odcienia metalu i acid rocka przez buczący dźwięk.
W 1990 doom metalowy amerykański Trouble na wprowadzili do swej twórczości elementy acid rocka, jeszcze mocniej zaakcentowane na wydanym w 1992 Manic Frustration. W Anglii zrodził się Cathedral, który po doomowych początków nagrał tak wyśmienite stonerowe płyty jak The Carnival Bizarre czy Supernatural Birth Machine. W 1992 z piasków sceny Palm Desert wyłonił się Kyuss ze swoim Blues For The Red Sun, obwołanym przez krytykę kamieniem milowym muzyki ciężkiej. Tego samego roku, pochodzący z San Jose Sleep wydał Holy Mountain - prasa fachowa zakochała się w grupie i jej nagraniach, obwołując ich wspołliderami rodzącej się sceny. Kolejnym wydawnictwem tamtego okresu był debiut Monster Magnet Spine Of God ze zmniejszona zawartością metalu na rzecz psychologizacji i gęstszego od piasku mułu. W 1994 Acid King i Acrimony wydały debiuty, adoptując psychodeliczne podejście do doom metalu. Z tamtego okresu warto również wyróżnić Fu Manchu, Clutch, Sons of Otis, Corrosion Of Conformity.
Kiedy Kyuss rozpadł się w 1995, jego ex-członkowie przyczynili się do powstania szeregu projektów, wciąż przemycających cechy typowe dla stonera. Pojawiły się The Atomic Bitchwax, Spirit Caravan i przede wszystkim Orange Goblin. Ta ostatnia formacja wpisała się już w kanony dojrzałego, mniej doomowego a bardziej psychodelicznego stonera. W następnych latach Pomarańczowy Goblin wracał do korzeni doom (na The Big Black), by następnie dodać do muzyki sporo punkowej zadziorności (Thieving From The House Of God).